尽管自己只接种过一次流感疫苗，但钟南山认为，在目前流感和禽流感病毒同时活跃的状态下，每年接种世界卫生组织推荐的流感疫苗，虽然只能保护抵御当年的预测流行毒株，并不能抵抗禽流感病毒，但至少可以减少流感样病例与症状相似的禽流感病例的混淆，以及避免流感与禽流感病毒同时感染人或猪，发生混和变异的可怕状况。
“我没喝过板蓝根，但我并不反对服用板蓝根。”针对老百姓习惯喝板蓝根来预防感冒，钟南山院士表示，到目前为止，给人服用的剂量中还没有发现一个成分对流感病毒存在有效作用。
据钟南山介绍，板蓝根抗流感缺乏严格的循证医学上的证据，仅仅停留在多年来具体病例积累的临床经验上，经验证明中药板蓝根可能作用于人体细胞保护，使其免受病毒侵害，或者是提高了人体免疫机能。
他同时表示，目前“呼吸疾病国家重点实验室”与广州白云山和记黄埔中药有限公司约定共同“寻找”板蓝根抗呼吸道病毒感染的有效成分和作用机理。
