在防禽流感、猪口蹄疫、链球菌病后，重视畜禽产品的卫生检疫已刻不容缓，随着我国加入世贸组织后对市场的要求，消费观念的转变，生活水平的提高，畜牧业有了较快的发展，畜禽的存栏量有很大的增加，山东外运供香港、澳门、上海、北京、深圳的猪禽越来越多，出入境的畜禽及产品的数量也随之增加。为保证人们肉食品的卫生安全，按照《动物防疫法》、《动物检疫管理条例》规定，对于流通环节、出入境的畜禽及产品进行严格检疫，以保证人们食用到健康、卫生、安全的畜禽产品。在对合格动物及产品开具检疫证明环节，检疫人员做出了突出的贡献，但是还有一少部分检疫环节执法难，严格检疫难，主要表现在以下几点：
一、认真执法检疫难。
按《动物防疫法》的规定，动物检疫员是实施动物检疫的实际操作者。国家要求动物检疫的执法主体是动物防疫监督机构，如县级动物卫生监督所。动物防疫监督机构根据工作需要，可以在乡镇畜牧兽医站和其他有条件的单位聘用专业兽医人员，作为动物防疫监督机构的派出检疫员，代表动物防疫监督机构执行规定范围的检疫任务。实际上每天的检疫工作是在凌晨3点进行，由于灯光暗，酮体的病理不是十分清楚。多数检疫人员是女同志，对屠宰户的粗言粗语畏惧，有的屠宰户明一套暗一套，宰3头说宰两头，也有的屠宰户凌晨3点钟宰1头，中午再宰1头，还有的屠宰户宰后不等检疫就批给卖肉商贩，更有的屠宰户不到点上屠宰。大的屠宰点一名检疫员凌晨3点起来一直到8点才下班，一头一头检疫都来不及动刀，只动眼看，只能是草草开了合格证了事。细说检疫程序是执法范畴的行为，按行政执法的要求，应该是2人或2人以上，在法律方面、传代技术方面、收银方面都有互相监督，清白执法，相互关照的优点。
简化了的检疫技术。动物检疫员按照《动物检疫管理办法》和农业部颁布的检疫标准、检疫对象的有关规定实施动物检疫，并对检疫后果负责。检疫质量高低直接影响动物食品的卫生安全，因此，要求检疫人员做到一丝不苟。检疫标准是使用什么方法进行检疫和判定，检疫对象是指什么病，如猪肉上市前要检疫的对象是猪瘟、猪丹毒、猪链球菌、口蹄疫、水疱病等，检疫合格后填写检疫证明。从开展产地检疫，绿色饲养监管以来，传染病几乎是没有，常见的只是偶尔有高温发烧和消化不良的病例，一般的检疫只是用肉眼看一看，也就是以看代检，习以为常，人人都这样，年复一年，一代接一代，解剖生理与病理鉴定、鉴别技术随着年轮而流失，不知不觉丢掉了动刀切割看淋巴病变的检疫方法，演变成只开证收钱的以眼看代刀的检疫。
病死猪、母猪肉的销售。熟练的业务人员一眼就可以看出肉的品质，多数业务人员用眼是看不出病死猪肉的，而是凭宰前检疫的检查，待宰圈里的猪都是合格的猪，留养的时间长，查看的时间长，看的人也多，不会有病猪和母猪这个道理屠宰户自己心里很明白，那么病死猪和母猪是在哪里杀的呢？据调查，有一个专收母猪、病死猪的加工厂，有一套专收病死猪的运输系统，这样的厂家、屠宰点，关系网也大，受到多方面的保护，有固定的屠宰检疫人员，封闭消息不外传，越宰利润越高，收购运输越活跃，监督检查无能为力。
二、建议改革动物检疫员的职责和执法程序。
官方兽医制。对辖区内动物及其产品实施检疫，出具检疫证明，并对检疫后果负责，现在负责的只是领导层，因为领导说啥就干啥，为小团体（本单位）的利益，领导指令检疫员违法，打埋伏，护人情，逃避检疫什么都干，偶尔被上级发现，惩罚的罚款也变着法地由单位拿。实行官方兽医制，检疫同时到现场，可以避免徇私舞弊、检疫不到位和不检疫就收费等许多问题。
解决屠宰点多面广、多收费问题。检疫员对辖区内饲养、生产、屠宰、加工、储存、运输、销售动物及产品的单位和个人，执行动物防疫及有关规定的情况进行检查，依据《动物防疫法》和《动物检疫管理办法》的规定，实际运作中每个屠宰点还有一套定点办发的“商业检疫单”，每份两元，宰一头猪两面缴检疫费，名称不一样罢了。有商检又有动检，合作检疫，简化检疫，减少收费，更有利于市场的管理和养殖业的发展。
