猪肉是人类动物蛋白的主要来源，我国是世界上生猪生产和猪肉消费的第一大国。我国种猪长期依赖进口，西方猪种虽生长快和瘦肉率高，但口感风味较差。该问题已经引起普遍关注。我国地方猪种具有肉质优良的特点，以“鲜嫩多汁”驰名中外。解析中外猪种骨骼肌生长发育差异分子机制是培育优良猪种的基础。
该研究以我国地方优良猪种—通城猪和著名瘦肉型猪—长白猪为研究对象，选取三个重要时间点（妊娠33天、65天和90天）的胚胎骨骼肌，利用LongSAGE技术比较分析其全基因组转录谱，从检测的317115个表达标签中鉴定了2648个差异表达基因。系统聚类分析发现两品种在妊娠65天时基因表达差异最大，且通城猪妊娠65天的胚胎骨骼肌具有独特的表达谱特征。对差异表达基因进行表达模式和本体论分析，发现骨骼肌发育过程中差异表达基因呈现8种不同表达模式，每种表达模式都分别富集了不同类别的功能基因。无论在表达模式还是富集的功能类别上，两品种的表达基因都存在很大差异。细胞生物学合成、细胞增殖调控、有机酸代谢、大分子生物合成、调节细胞大小等相关基因多在通城猪骨骼肌发育过程中差异表达。此外，还发现通城猪骨骼肌的发育涉及到了更多类别功能的功能基因。
该研究认为，通城猪和长白猪的基因表达表型差异显著，通城猪胚胎骨骼肌具有相对缓慢的生长速度和更复杂的分子机制，而增加细胞生长和成肌细胞生存的基因在长白猪中表达上调。他们还推测，妊娠65天可能是导致两品种生长性状差异显著的重要时间点。
该研究由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、华中农业大学动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、上海华冠生物芯片有限公司共同完成，全部工作均在国内完成。此项研究是国家自然科学基金重点项目资助课题，并得到国家863和973计划资助。（国农业科学院北京畜牧兽医研究所 李奎研究员课题组）
