一是继续加大艾滋病防治工作力度。建立完善防治工作长效机制；大力宣传贯彻《艾滋病防治条例》，落实“四免一关怀”政策；实施重点地区、重点场所、重点人群HIV筛查，加强健康教育和行为干预，大力推广和实施干预措施，有效阻断艾滋病的传播；完善县、乡、村三级母婴阻断工作网络，落实激励措施，确保各项目标和干预措施落到实处。
二是强化结核病控制项目的监督管理，做好世行贷款／英国政府赠款结核病控制项目、全球基金结核病控制项目、中央转移支付加强结核病控制项目工作，落实结核病“三免”政策，推动结核病防治工作的深入开展。
三是加强霍乱和0157：H7、乙脑、疟疾等传染病监测工作，落实流脑、狂犬病等传染病的防治措施，加强监测，搞好预报，防止暴发流行。强化应对流感大流行各项措施，提高疫情应急处置能力。
四是重点做好消灭脊灰和免疫规划工作，加强基础免疫常规接种工作；继续推广乡镇卫生院门诊规范化接种，完善入托、入学查验预防接种证制度；提高首针免疫及时率，确保“四苗”接种率、新生儿乙肝疫苗全程接种率要保持在90％以上。
五是进一步完善突发公共卫生事件监测预警、应急报告、事件举报、应急处理、工作督导等制度，提高突发公共卫生事件应急处置速度和效能，依法组织协调有关突发公共卫生事件应急处理工作；以乡镇卫生院为重点，加强对法定传染病和突发公共卫生事件网络直报工作的督查和督导力度。加强疫情专报人员管理和培训，提高法定传染病和突发公共卫生事件的网络直报率和报告质量，及时开展疫情追踪调查；完善突发公共卫生事件监测和预警系统，加强卫生应急队伍建设，组织开展应急能力培训和演练，提高其危机管理意识、应急协调管理能力和现场处置能力；协助财政、规划等部门建立完善卫生应急资金和物资储备机制。
