1．推进现代渔业建设。围绕中央关于发展现代农业推进社会主义新农村建设的总体要求，分析渔业发展面临的形势、任务和要求。在总结实践经验的基础上，结合各地实际提出建设现代渔业的思路、措施和政策保障。
2．渔业基本经营制度研究。对当前我国渔业水域滩涂、渔业船舶等生产资料的权属性质、经营主体和经营方式进行调查、分析和研究，对现有渔业基本经营制度作出总体评价，分析其合理性，查找存在的问题。提出稳定和完善我国渔业基本经营制度的政策建议。
3．渔业水域滩涂占用补偿制度研究。调查分析渔业水域滩涂占用的基本情况和典型案例，分析总结目前一些地方水域滩涂占用补偿的主要做法及存在的主要问题，参照国际上和我国农地的相关做法，提出建立健全渔业水域滩涂占用补偿制度的设想和建议。
4．转变水产养殖业增长方式。总结研究水产养殖业发展现状，剖析进一步发展的制约因素，探讨进一步转变增长方式、发展优质健康水产养殖业的途径及措施保障；在分析研究的基础上提出可行性政策建议。
5．水产品质量安全制度和政策研究。研究总结我国水产品质量安全工作的经验，剖析质量安全监管中的薄弱环节和突出问题。从社会学、经济学和管理学的角度，探讨解决水产品质量安全问题的长效机制。
6．平安渔业建设。总结近年来平安渔业建设的做法、效果和经验，分析当前我国渔业安全生产管理中存在的突出矛盾和问题，探讨在建设社会主义新农村、构建和谐社会的历史背景下，平安渔业建设的思路、重点和应当采取的政策措施，以及如何建立和完善长效机制。
7．新形势下完善捕捞渔民转产转业政策研究。总结各地实施减船转产工程的情况、经验和存在的突出问题，分析当前转产转业政策面临的新形势和新要求，探讨减船转产的新思路，提出进一步改进和完善转产转业政策的建议。
8．渔区社会保障制度研究。调查研究各地建立实施渔民最低生活保障等社会保障制度的状况，总结典型经验，研究存在的问题；分析国外渔（农）民社会保障的经验；结合当前中央“三农”精神，分析提出建立健全渔民最低生活保障等社会保障制度的政策建议。
9．渔民专业合作组织研究。调查了解渔民专业合作组织发展情况，总结经验查找问题，结合《农民专业合作社法》的贯彻，探讨引导扶持渔民专业合作组织进一步发展的思路及政策措施。
10.渔船管理问题研究。调查研究当前我国渔船管理现状，总结取得的经验和存在的突出问题，深入分析其中的原因，探索加强和完善渔船管理的途径和方法。
