由于养殖者过分追求高密度、高产量，不重视种质优化和水质环境等方面的原因，导致养殖病害严重，滥用药物的现象普遍存在，水产品质量安全事件时有发生，对养殖业健康发展造成严重负面影响。
各地渔业行政主管部门依法负责水产品质量安全管理工作，并组织渔政机构、水产品质量监测检测单位等开展检查，切实履行监督管理职责。各地重点规范苗种、饲料和药品的使用和管理，指导监督苗种场、养殖场建立健全生产记录、用药记录、销售记录，建立苗种场、养殖场登记备案制度，切实把这些制度落到实处。
同时，充分发挥企业、农民合作组织、行业协会在加强行业自律方面的积极作用。坚持“预防为主，防治结合”的方针，逐步建立渔业官方兽医、执业兽医和渔业用兽药处方制度，加强水生动物防疫工作，做好重大水生动物疫病专项监测，完善各级《水生动物疫病应急预案》，强化突发疫情的快速反应能力，提高防控能力和监管水平。
渔业部门要重点加强养殖环节用药行为的监管，推进批发市场和生产环节水产品监测工作，扩大监测范围、增加监测品种和抽查频率，对问题产品要开展追溯调查和查处。
