市面上的蓝耳病疫苗主要有两种，一种是灭活苗，另一种是弱毒苗。到底哪种效果好应该在何时注射才能取得好的效果呢？活苗的缺点是：把它注射入体内的效果与感染野毒没有多大差别。对完全蓝耳病阴性的场或已经是蓝耳病阳性的猪，当注入另外一种毒株的的PRRS疫苗后，它会同野毒一样照样穿过胎盘侵害胎儿。有时，如果我们所使用的疫苗的基因序列与某一群体存在的PRRS病毒基因序列相似性达到70%～80%时，疫苗会比较有效。如果我们所使用的疫苗的基因序列与我们本场存在的PRRS病毒基因序列不同时，则意味着可能会有一场新的蓝耳病到来。市面上存在的另一种疫苗是灭活苗。它的缺点是：诱导有效免疫力的能力比较差。但毫无疑问，灭活苗在使用上是比较安全的，可以诱导一定的抗体产生，如果抗体与野毒的基因序列比较相似，同样还会产生保护；如果基因序列不相似，则保护力比较差。这就是这两种疫苗的不同之处，了解到他们的缺点后我们在生产实践中就要避免它。所以要根据每个场子不同的情况来选择疫苗。灭活苗的安全性大大高于弱毒苗，而且不存在散毒的危险，然而再好的灭活苗的效果也不能和弱毒苗的效果相比较的。所以对于种猪和阴性场应该选用灭活苗。而阳性场为了净化蓝耳病最好选用免疫效果好的弱毒疫苗。
同圈猪可以打苗，建议最好全群一起打，病猪怀孕猪都是可以打的，但对于病得太严重的建议就淘汰了吧。打蓝耳苗【注意事项】（1）疫苗使用前应恢复至室温，并摇匀。（2）注射部位应严格消毒。（3）对妊娠母猪进行接种时，要注意保定，避免引起机械性流产。（4）本疫苗接种后，有少数猪接种部位出现轻度肿胀，21日后基本消失。（5）屠宰前21日不得进行接种。（6）应在兽医的指导下使用。
