选育良种，培育优质新品系该项目通过分子育种技术、高效快速繁殖技术以及新品系选育与配套杂交组合筛选等，培育出一批优质新品系（配套系），已有的畜禽新品系生产性能也大大提高。
同时建立了常规育种技术、分子育种技术、信息技术相结合的育种新体系和蛋鸡、黄羽肉鸡及水禽区域联合育种等新体系。
5年来，累计育成新品系（种）31个，形成了畜禽优质高效配套组合60个。年可供肉牛胚胎670枚，肉牛冻精年供种能力达到605万份；瘦肉型猪年供种能力达到12万头以上；奶牛年生产胚胎能力达到1万枚；纯种肉羊冻精63万剂、鲜精37万剂；中国美利奴羊育种群种公羊超细型达到2593只，细型达到18842只；推广父母代蛋鸡120多万套，合计商品代蛋鸡6000万只以上；初步建立起瘦肉型猪全国联合育种新体系。
项目实施以来，累计出栏优质瘦肉型商品猪3369.9万头，肉牛403万头，肉羊959.6万只，优质黄羽肉鸡7900万只，肉鹅2474万只，肉鸭6409万只；项目结束时存栏蛋鸭1295万只，细毛羊380万只，健康养殖蛋鸡50万只。累计获得经济效益达160.91亿元，对全国畜牧业的持续发展起到了良好的示范带动作用。
关键技术成果累累在项目实施过程中，通过畜禽高效养殖技术研究，获得了蛋鸡健康养殖生产技术、新型兽药和新型饲料添加剂、舍饲、半舍饲肉羊饲养技术体系等一系列新成果。
———单胃动物营养调控技术研究，开发了减缓断奶仔猪生产性能下降的调控和黄鸡肌内脂肪沉积营养调控等一批新技术。
———在反刍动物营养调控技术研究中，开发了肉羊高效、无公害饲料添加剂、益生微生物培养物等新产品。
———饲料添加剂研究与产业化技术，开发出植物来源营养利用调节剂、免疫增强剂提取分离工艺、天然抗菌剂、仔猪益生乳酸杆菌复合制剂、微生态复合制剂等多种制剂。
———通过优质环保型配合饲料生产及质量保证关键技术研究，建立了饲料原料中农药残留的检测方法1套；制定了饼粕类、动物性蛋白类、动物性矿物类原料的安全使用标准3类17种和防霉剂、酶制剂、抗生素添加剂、抗氧化剂、黏合剂、活菌制剂、香味剂等饲料添加剂安全使用标准8项。
———通过畜禽养殖环境调控技术研究，开发出通风、降温、除尘多用途冷风机、微缝地板和离地圈养清洁猪床、节能暖床、新型整体式侧窗及其安装工艺；研制出“能量自用型”大中型猪场污水处理工艺及配套设备等多种新工艺、新设备。
示范区良种覆盖率100%
该项目在完成了各项技术经济指标的同时，在畜禽规模化养殖与产业化示范方面取得显著成效。建立了试验示范基地、成果推广基地和示范场(点)390个，其中3个基地获得无公害农产品产地认定。在示范区和基地实现了“良种、养殖、管理和加工”一体化、标准化，良种覆盖率达100%，
示范区(基地)建立起较为完善的“优质、高效、安全、环保”的瘦肉型猪、优质肉牛、肉羊、细毛羊和蛋鸡规模化养殖生产技术体系，养殖环境达到国家环保标准，没有发生重大流行疫病。建立了畜禽专用饲料、添加剂、饲料产品加工质量、饲料高效利用、畜产品品质的营养调控以及瘤胃调控评价等新技术73项(套)，获得新产品22个，新工艺14套，新设备7种，制定了技术标准（规程）36套。
