《办法》规定下列区域应当划定为禁养区:生活饮用水水源保护区、风景名胜区、自然保护区的核心区及缓冲区；城市和城镇中居民区、文教科研区、医疗区等人口集中地区；市区范围内实行城市化管理的地区等。
《办法》规定的限养区为:市区绕城公路外沿500米以内的区域，国道、省道两侧各500米以内的区域，集镇规划区，禁养区以外根据城镇发展规划和区域污染物排放总量控制需要，应当限制畜禽养殖的其他区域。
《办法》规定，限养区内禁止新建扩建集约化畜禽养殖场，《办法》实施前限养区内已有的集约化畜禽养殖场应控制畜禽养殖规模，削减污染物排放总量，实现污染物达标排放。违反者将被责令限期改正并处以1000元以上3万元以下的罚款。
近三年来，杭州市城区开展了以生猪及奶牛为主的大规模畜禽禁养活动，累计削减生猪44.4万头、奶牛1万余头、家禽386.5万羽，使河道水质明显改善，饮用水富营养化趋势得到有效遏制。
