随着人们生活水平的提高，人们对动物产品的卫生质量安全水平要求不断提高。在广州市畜牧业生产中，畜牧生产的标准化、产业化水平仍然偏低，滥用抗菌素、饲料添加剂的情况仍较严重，非法使用“壮冠素”、“肥鸡丸”、己烯雌酚等药物的现象仍然存在。
同时，广州商品流通发达，消费人口超千万，是排名全国前列的动物产品消费市场及集散地，广州消费的生猪等畜禽产品大部分靠外地输入，大量外地输入的畜禽产品的检疫及质量监测任务相当繁重。近几年外地输入广州市的生猪“瘦肉精”残留一直居高不下，在农业部组织的全国性抽检通报中，广州市多次都列入生猪“瘦肉精”残留超标严重的城市名单。
此外，广州市动物防疫监督所有关人士还表示，正在建设当中的动物疫病监测中心，首期建设用地不足、动物疫病及动物产品质量安全监测实验室面积不足，实验室监测仪器设备装备水平与工作的需要还有差距，这将不利于提升广州市对重大动物疫情的应急反应。
多年以来，广州市镇级畜牧兽医站属于事业单位，但事实上大多数镇级站都是按照类似集体所有制企业进行管理，编制被占用、人员入不了编，这也使得防疫工作无人做，对动物防疫造成了很大的阻力。
《规划》中提到，在今后五年，广州将努力建成重大动物疫病免疫无疫区和动物产品质量安全区。对高致病性禽流感、口蹄疫、狂犬病、猪瘟等重大动物疫病，实行全面免疫。
为了全面落实市外调入动物、动物产品的检疫和质量安全检测，广州逐步在各区、县级实行标准化、信息化管理，建立动物检疫和质量安全溯源体系；同时，全面开展产地检疫工作。据统计，广州年出栏3000头以上的猪场近百家，畜禽原种场和种禽孵化场的个数约占全省的三分之一，对此，在今后五年，广州的规模畜牧生产场的产地检疫率将达100%，奶牛“两病”（即结核病和布病）的检疫率达100%.今年，广州市农业局与输入广州生猪较多的来源地湖南、广西合作，与当地大型养猪场、养猪协会以及当地牧畜办签订安全优质生猪产销协议书，从源头保证生猪的质量安全。
据透露，广州将争取在五年内，动物产品质量安全指标达到国内先进水平，动物产品市场抽检合格率达92%以上，本地原产动物产品抽检合格率达95%以上。重大动物疫病免疫所用疫苗不少于该品种年使用量的8%。
《规划》还指出，广州动物防疫监督所将对辖区内畜禽批发市场、大中型畜牧生产场的上市动物产品，重点加强盐酸克伦特罗（瘦肉精）、氯霉素、磺胺类、激素类等药物残留的监控；制定动物、动物产品批发市场检疫操作程序，建立检疫档案，建立与产地的联系机制；重点查验动物的产地检疫证明、免疫证明、动物是否来自非疫区，结合临床检查，对重大动物疫病定期或不定期进行免疫抗体水平和病原学检测；建立市场信息发布系统。在规模畜牧生产企业、屠宰场、畜禽交易市场、动物产品贮藏冷库、养殖区等设立动物防疫管理信息收集及服务网点。
