根据纽约路透社报道，食品污染菌－大肠杆菌会造成腹泻、尿道感染以及许多人类严重的疾病。一份研究显示：鸡身上的大肠杆菌对氟奎诺酮类（Fluoroquinolones）的抗生素具有抗药性，因为鸡等动物被大量注射抗生素，而抗生素会导致微生物突变，使其产生抗药性，食物链顶端的人类很容易从食物来源而感染抗药性大肠杆菌。
学者指出：阻断食物中抗药性微生物入侵人体，最好的方法不是继续开发更强的抗生素，而应该从其他方向着手，包括：对食品加工过程的卫生情况严格把关，或改用X射线、紫外线等对有疑虑的食品进行杀菌，此外，改善厨房卫生条件也很重要。
根据期刊Journal of Infectious Diseases资料，1990年后期，明尼苏达大学研究显示：巴塞隆纳医院某食物中毒案件，有35个病人的血液样本及33个病人的排泄物样本发现大肠杆菌。在同一地区的3个鸡屠宰场鉴定出49个样本也有大量大肠杆菌。其中30个人体样本及30个及样本均对Cipro（一种氟奎诺酮类抗生素）有抗药性，且人与鸡身上分离出的抗药性大肠杆菌在毒性及其DNA序列都很相似。这些数据说明人体可能间接从食物（例如家禽）而感染具抗药性的大肠杆菌。
Johnson教授强调若以上推论是正确的，那么如何将这些致病菌从食物来源中消除，将是未来要努力的课题，因为这些具有抗药性的病源菌对人体健康会造成严重的危害。
