2005年，浙江省畜牧养殖业总产值达285.9亿元，包含饲料兽药产业、畜禽养殖业和畜产品加工业在内的畜牧大产业产值超过1200亿元，全省从事畜牧大产业的超过200万人，农民家庭经营平均有268.3元来自畜牧业。畜牧业为农业增效、农民增收、农村发展发挥了重要作用。
新农村建设进程中，现代化畜牧业发展前景广阔。从外部政策看，国家确定了工业反哺农业、城市支持农村和“多予、少取、放活”的方针。今年的中央1号文件明确提出了大力发展畜牧业、加强动物疫病特别是禽流感等重大动物疫病防控的基础设施建设、加快推进畜牧兽医体制改革等政策，为畜牧业的发展营造了良好外部环境。从内在规律看，发达国家的养殖业比重占大农业的50％以上，而就浙江省来看，这一比重仅为21％，居民对畜产品的数量和质量要求将持续提升，畜牧业发展潜力和空间很大；在大农业中，畜牧业的行业经济比较优势明显，通常情况下饲养一头猪的效益相当于半亩粮，必然会吸引更多的资本投向畜牧业。
同时，新农村建设进程中，现代畜牧业发展也面临严峻挑战。新形势下，如何突破瓶颈，打好科学发展现代畜牧业的基础，辩证处理好三个关系十分重要。
正确处理好生产发展与动物防疫的关系。畜牧生产发展和动物疫病防控是一个辩证统一的关系。落后的畜牧生产方式传播疫病，现代先进的生产方式有利于疫情防控。在当前动物疫病污染面比较广、畜产品大流通、甚至候鸟也可能传播疫病的情况下，落后的养殖方式很容易引致疫病发生。而标准化的现代生产方式是有效防控动物疫病、阻断人畜共患病向人间传播的根本途径。丹麦、荷兰等畜牧业发达国家，基于先进的生产方式，已经多年未发生重大动物疫病。我省生产方式相对先进的规模养殖户重大动物疫病发生几率远低于散养户。从另一个层面上分析，这几年来，我国包括我省特别是一些畜产品的主销区在堵截外来疫病、扑灭输入性疫情方面投入了大量人力、物力和财力，防疫工作十分被动，个别地方因扑疫不及时、不彻底，甚至造成面上的疫源扩散污染，直接间接损失很大。如果把这些扑疫资金、精力用在发展畜牧生产上，经过5年乃至10年的积累，就可以在一个区域发展一个现代健康的畜牧产业，从而有效保障优质安全畜禽产品供给，牢牢掌握防疫工作主动权。因此畜牧产业发展和动物防疫并不矛盾，只要把握两者内在的规律，坚持按规律办事，充分发挥主观能动性，两者相辅相成。
正确处理好产业发展与环境保护的关系。从根本上说，畜禽排泄物是一种资源，既可以直接作为种植业的肥料，也可以经过适当处理，转变为有机肥、沼气和生物蛋白，只有在放错地方、无法利用的情况下才变成污染源。因此，畜牧业本身也不是污染产业，只有无序发展的畜牧业才会污染环境。近几年，一些畜牧业主产区没有有效治理粪便，破坏了养殖场周围水源、空气、村庄的清洁，究其原因，主要是缺乏前期规划和后续治理，畜禽排泄物超过了外部环境和设施的消纳能力，打破了生态的平衡。从国外和我省部分地方的成功实践看，科学规划、有序发展的畜牧业不仅不会污染环境，而且是促进生态循环和资源节约利用的有效途径。丹麦是一个生猪业十分发达的国家，政府通过“科学规划、控制规模、配方施肥、有序监管”，有效地防止了畜禽排泄物的污染。该国法律对农场的面积和农场主可拥有家畜的数量都有限定。每个农场饲养家畜的数量不超过500个单位。一般农场达到250个单位时，相关部门就要对其进行环境效应评估，确定能否扩大规模。粪便要经过发酵处理后按规定时间(春秋两次)施入田间，化肥的种类和数量严格按专家推荐的标准施用。从去年我省108家规模养殖场的治理看，各地通过农牧配套、有机肥加工、沼气发酵、设施处理等多种途径，很好地实现了畜禽排泄物的减量化、无害化和资源化，推进了高效生态农业发展。只要我们坚持生态优先，科学规划，适度发展，种养结合，控制畜禽排泄量和外部消纳量平衡，畜牧产业的发展和生态环境的保护必然会和谐共生。
正确处理好应急防疫和长效防控的关系。从自然规律看，只要畜牧业存在，动物疫病也必然长期存在，甚至会层出不穷地发生新疫病，如果只依靠应急防控，永远处于被动，只有坚持预防为主，实施长效防控，才能掌握动物防疫工作的主动权。新时期的动物疫病防控必然由应急防控为主转向长效防控为主、应急防控为辅。长效防控工作基础打好了，应急防控工作就会逐步减少，即使在突发疫情时需要启动应急程序，也会更加有力、有序、有效，起到事半功倍的效果。正确处理好应急防疫和长效防控的关系，一要加强责任体系建设，特别要进一步落实政府动物防疫责任，将重大动物疫病防治工作全面纳入对乡镇政府的综合目标考核，同时要强化部门、官方兽医、执业兽医和畜牧业主体的防疫责任体系，实现群防群控。二要加强动物防疫体系建设，深化畜牧兽医体系改革，切实加强动物防疫力量和动物防疫基础设施建设，提高综合防控能力。三要加强防控措施落实。把100％免疫到位作为防控重大动物疫病的首要措施来抓，同时在免疫评估、检疫规范、流通风险评估等方面进一步健全工作机制，加强监管，确保综合防控落到实处。四要加强科学防控。要依靠科技创新，应用科学的免疫程序、消毒措施、防疫设施，提高防疫科技水平。
