研究结果指出，虽然同为H5N1病毒，但病毒的地区分化可能给人用疫苗研制带 来巨大挑战。因为虽然很多国家都在研制禽流感疫苗，但一般都是根据本地的病毒分支类型，如果出现了新的变异，或者遇到另一种病毒亚型，疫苗在临床效果方面可能会不尽如人意。而实际情况是，H5N1型禽流感病毒过去10年中在完全不受控制的情况下传播，当前在我国和东南亚传播的病毒变种已经太多，从而造成生产常规H5N1病毒疫苗的努力可能没有结果。
我国和东南亚目前发生的禽流感的科研小组日前完成的一项研究表明，常规H5N1型病毒疫苗可能对多年来已经产生基因变异的病毒无效。汕头大学的陈鸿霖教授在我国内陆和香港地区禽鸟身上提取的1万多份分泌物，和东南亚等其他地区的病毒样本进行了基因对比，表明其均出自于同一个H5N1病毒原型。
