各地督促检查的主要内容包括：党中央、国务院关于防控禽流感工作的一系列重要指示、全国防控高致病性禽流感指挥部有关会议精神的贯彻落实情况，以及省(自治区)政府和指挥部近期有关防控工作会议和文件的贯彻落实情况；各地防控应急指挥部启动及运行状况，以及下属机构设置、职能分工和工作开展情况；各级政府防控禽流感资金安排及落实情况，包括疫情监测费、强制免疫费、应急物资储备资金、应急工作准备资金、疫苗购置配套经费等；基层动物防疫体系及其工作运转情况；免疫工作进展情况；疫情监测机构设置、人员配备和工作运转情况；畜禽产品检疫和流通环节监管工作开展情况；科学防控知识的宣传普及与公众了解掌握情况。
福建省机关效能建设领导小组办公室抽调力量，组成5个督查组深入基层，开展防控禽流感效能督查工作。湖南省政府组织了7个督查组，由省防控指挥部成员单位的厅级领导带队赴各市、县开展督促检查；同时，组成5个暗访组，配合检查各地防控措施的落实情况。广西近期组织了14个专家组连续3次对全区重大动物疫病防控工作进行督查。青海省组成8个工作组分赴各市、县督查和指导防控工作，落实各项关键防控措施。
在督查工作中，各地采取听汇报与查资料相结合、走访相关人员与实地检查相结合、按程序明查与组织暗访相结合等多种形式开展工作，推动各地全面落实各项防控措施。湖南省的暗访组采取“不打招呼、自备伙食、随机检查、从下而上、离前通报”的方式有效开展检查工作；广西督查人员深入基层,深入农户,细致观察,认真记录，切实开展督查工作。
督查组在工作中，既肯定各地禽流感防控工作的做法和成效，又严肃、明确地指出存在的问题和不足，提出改进意见和建议。同时，向政府有关部门及时反映各地防控工作中遇到的困难与问题，帮助联系，协调解决，有效推动防控工作的深入开展。
