2005年乙型脑炎对种公猪的危害十分严重，福建省乙型脑炎对种公猪危害主要反映为以下三种情况：
1、种公猪无性欲。正常饲养情况下，种公猪到8月龄，或体重100千克时仍无性欲。这种公猪往往是睾丸一大一、或两个睾丸均发育不良，而且种公猪培养过程中有过发烧、睾丸一侧或两侧肿大的病历。
2、种公猪有性欲，但配种后母猪返情。种公猪配种正常，但配种后100％的母猪返情，经检查发现公猪精液中无精子、死精子或活精子数量很少。
3、种公猪性欲减退。种公猪爬跨母猪的兴趣愈来愈小、直到不爬跨。种公猪睾丸先肿大后缩小。
乙型脑炎对种公猪危害是不可逆转的，已感染乙型脑炎致病的种公猪没有治疗价值，只能淘汰。因此乙型脑炎对种公猪的危害大，给种公猪饲养户带来不小的损失。为保证我省种公猪饲养农户的利益，现就乙型脑炎的预防作一介绍。
乙型脑炎又叫日本脑炎，是一种由病毒引起的人畜共患传染病，主要由蚊虫叮咬传播，因此作好养殖环境的灭蚊灭蝇工作，能减少乙型脑炎疾病传播。科学免疫则是预防乙型脑炎根本，但其免疫接种的时间又是确保免疫效果的关键。对于后备种公猪的第一次接种，时间不能早于5月龄，早于5月龄给公猪作乙型脑炎疫苗接种是无效的。正确作法是种公猪出生后的五个半月到六月龄间进行第一次猪乙型脑炎疫苗接种，之后种公猪每年春季（3-4月份）在蚊蝇出来前进行一次免疫，用灭活苗或弱毒苗免疫均有良好效果。
