1.1 益生菌(素)：是从健康动物菌群中经过筛选和人工培养制成的活菌制剂。目前，生产实践使用较广泛的益生菌有两种，一种为单一菌属组成的单一制剂，另一种为两种或两种以上不同菌属组成的复合菌制剂，一般来说后者比前者对促进畜禽生长及提高饲料转化率效果更好。
1.2 益生元：Gibson首先提出益生原概念，是指一种非消化性食物成分，能选择性促进肠内有益菌群的活性或生长繁殖，起到增进宿主健康和促生长的作用。最早发现的益生元是双歧因子，后来又发现多种不能消化的寡糖可作为益生元。如乳果糖、蔗糖、寡聚糖等。这些寡糖不被有害细菌分解和利用，促进有益菌生长，达到调整菌群的目的。益生元的优点主要是，稳定性强，有效期长，不存在保持活菌数的技术难关，还可以提高机体的免疫功能。
1.3 合生元：为益生菌和益生元联合的微生态制剂，其特点是同时发挥益生菌和益生元的双重作用。该制剂的应用有日渐增多的趋势。
2 按微生态制剂菌种分，可分为乳酸菌类，双歧杆菌类，芽胞杆菌类微生态制剂。
2.1 乳酸菌类微生态制剂
乳酸杆菌制剂的应用历史最早，制剂种类最多，相对效果最好。乳酸杆菌是健康动物肠道中极为重要的生理菌群之一，无毒、无害、无副作用，能促进免疫细胞、组织和器官的生长发育，提高免疫功能。乳酸杆菌对肠道中的厌氧菌群有扶植作用，而对需氧菌群的生长则起限制作用，有助于宿主调整肠道正常菌群彼此之间的相互关系，维持微生态环境平衡。主要包括：嗜乳酸杆菌、保加利亚杆菌、莱氏乳杆菌、植物乳杆菌、干酪乳杆菌、短小乳杆菌、唾液乳杆菌、德氏乳杆菌、高加索乳杆菌、纤维二糖乳杆菌及酸乳酪乳杆菌等。
2.2 双歧杆菌类微生态制剂
双歧杆菌是当今国内外最受关注的益生菌制剂，先进国家几乎都有生产，并有多种剂型。其作用不仅治疗多种疾病，而且具有保健和延年益寿的作用。该菌为厌氧菌，共有28个种，30多个亚种或型。常用的双歧杆菌有两歧双歧杆菌、婴儿双歧杆菌、长双歧杆菌、短双歧杆菌、青春双歧杆菌和猪双歧杆菌等。
2.3 芽孢杆菌类微生态制剂
芽孢杆菌在动物肠道微生物群落中数量较少，但优点很多，与乳酸杆菌相比，能耐受胃内酸性环境，稳定性较高，而且有较强的蛋白酶、脂肪酶和淀粉酶等多种有效的酶促活性。目前生产中应用的芽孢杆菌主要有：枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、腊样芽孢杆菌、东洋芽孢杆菌、环状芽孢杆菌和短小芽孢杆菌等。日本、意大利、美国、英国、德国等均有芽孢杆菌属制剂的报道。国内于20世纪70年代末，选出了耐酸、耐碱、耐高温、耐高压、储存时间长、井有很强蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶活性的有益芽孢杆菌，并研制出适宜不同动物的微生态制剂。
2.4 酵母类微生态制剂
酵母虽然零星存在于动物肠道中，但其可为动物提供蛋白质、帮助消化、刺激有益菌生长、抑制病原微生物繁殖，提高机体免疫力和抗病力，对防治消化道系统疾病有重要意义。目前应用的主要有啤酒酵母和石油酵母。
2.5 优杆菌类微生态制剂
优杆菌能分泌乳酸、促进饲料消化，抑制病原菌，刺激有益菌生长，但稳定性较差。另外还有拟杆菌制剂，黑曲酶和米曲酶制剂等．在我国的研究尚属起步阶段。
