该病是由球虫寄生于肠道引起的以出血性肠炎为特征的疾病，全世界报道的牛球虫有19种，我国报道有16种，多发生于犊牛。病原主要是牛艾美耳球虫和邱氏艾美耳球虫。
据调查显示，2003年上海地区的七个牧场0-6月龄犊牛球虫发病率为14.4%，牧场之间发病率差异较大，可见加强牧场的卫生管理工作是何等的重要。
危害 犊牛一般为急性经过，病程约一周到两周左右。由于球虫主要在大肠内繁殖，会致使肠道粘膜上皮大量脱落，进而出血。犊牛表现出精神萎靡、血便、腹痛、脱水，严重者死亡。若治疗不及时，后期往往会伴随继发感染，体温升高。慢性病例则会逐渐消瘦、贫血，形成僵牛甚至死亡。这对后备牛的储备，保证牧场生产的连续性是一个威胁。
解决之道 对当前牧场而言，所需要做的是将预防措施落实到位。尽管牧场已经逐渐意识到这个问题的严重性，但在做的过程中缺少监督机制，没有规范化。建议加强监督，责任落实到个人，药物预防要按规定剂量、规定时间操作，保持环境干燥、清洁，定期消毒。尽量做到每一项工作都有临床记录，以保证预防措施到位。
对于已经发生了球虫病的牧场，只要及时治疗，一般都会有很好的效果。具体措施简要归结如下：
①分群饲喂。
②牛舍、器具等定期消毒并记录，保持牛舍环境清洁干燥。
③饲喂的代乳料或者初乳质量要可靠，未被污染。
④药物预防，主要有氨丙啉、磺胺类药和抗菌增效剂等，值得注意的是要按规定剂量和时间用药，防止产生耐药性，并要有记录。
隐孢子虫病
本病是由鼠隐孢子虫和小隐孢子虫寄生于奶牛肠道，特别小肠后端引发的疾病，是一种呈世界性分布的人畜共患病。对奶牛而言，能引起犊牛严重腹泻，会给养牛业造成巨大的经济损失。该病还会引起严重的公共卫生问题，为世界上最常见的6种腹泻病之一，也能引起人(特别是免疫功能低下者)患病。
隐孢子虫的生活史简单，不需转换宿主就可以完成内生阶段，随犊牛粪便排出的卵囊具感染性。其中鼠隐孢子虫可引起中等程度的腹泻，小隐孢子虫可引起水样腹泻，主要集中发生在3周龄左右的犊牛。国外报道犊牛(4-17日龄左右)发病率达50%以上，国内在北京、湖南、河南等省市调查的感染率为5.3～40%。国内外常用的检测方法为涂片染色和PCR法。
危害 本病的临床症状和严重程度取决于宿主的免疫功能与营养状况。食欲下降、腹泻、脱水是本病的主要特征。若单独感染腹泻可持续7天以上，继发感染或者混合感染则会出现脱水、酸碱失衡、腹泻等，加上营养不良也会引起僵牛，进而影响牧场的后备牛体系建设。
解决之道 细胞免疫和体液免疫对消除该寄生虫的感染是必不可少的。不论免疫功能是否正常，感染该虫后血中均可检出特异抗体。但因该虫寄生于肠粘膜表面，体液中的抗体可能不起完全保护作用，但能降低再感染的严重性。所以在目前饲养条件下，对于犊牛而言，应及时饲喂初乳，这对提高犊牛免疫力尤其重要，也是最简单最有效预防犊牛腹泻的方法。同时牧场不能一味追求降低成本而使用低质量的代乳粉，否则容易造成一旦发病就是成批发病的不良局面，对牛群今后发育影响深远。
新孢子虫病
新孢子虫病是近年来才确认的一种新寄生虫病。病原是犬新孢子虫，可以感染犬、猫、牛、马等动物，是一种动物源性疾病，主要寄生于中枢神经系统、肌肉、肝脏、脑及其它内脏，引起以孕畜流产、死胎以及新生胎儿运动神经系统障碍为特征的疾病。迄今为止，经胎盘感染是已知的惟一途径，可在新生胎儿的肌肉、肺呼出物、皮肤脓包渗出物、脑组织检查到新孢子虫，多出现在怀孕后4-6个月。
该病呈世界性分布，国外奶牛感染率为10～40%，最高可达82%，是奶牛流产的主要原因之一。该病已成为国际寄生虫界研究热点，我国对该病研究仅限于血清学调查。据报道，北京及山西部分牧场有流产史的牛新孢子虫抗体阳性率为23.5%，且所有被检血清均为龚地弓形虫抗体阴性。
危害 成年牛感染后可引起流产、死胎，或者新生胎儿表现运动神经系统障碍，出生犊牛成活率低下等。事实上流产是牧场管理人员不愿看到的，其对牧场损失不言自明。
解决之道 目前没有特效的解决办法，但从防疫的角度可以看出，加强牛群环境管理，切断传染途径是比较可行的措施。保证牛床等正常情况下的干燥清洁卫生，做好日常的消毒工作，并确保消毒效果。
胎儿毛滴虫
牛胎儿毛滴虫病是由胎儿三毛滴虫寄生于牛生殖道引起的疾病。该病呈世界性分布，主要发生在母牛怀孕后3-5个月。毛滴虫病被国际兽医局(OIE)列为B类疾病，我国列为三类疫病。该病主要通过自然交配和人工授精的精液以及器械传播。国外的报道显示该病感染率维持在2～5%的水平，而在有些地区感染率达到15～40%。国内尚未有相关感染率的调查研究报告。
危害 主要危害在于引起奶牛生殖器官炎症、死胎、流产和不育等，临床表现有脓性卡他性阴道炎、子宫内膜炎等。
解决之道 保证精液来源的可靠性，开展人工授精和加强检疫，在输精时应注意手臂、输精器械的消毒。
总之，从当前牧场管理现状来看，尤其需要加强后备牛只的管理，对喂初乳、药物预防疾病等具体工作进行监督，责任落实到个人，并做到有详细的记录。只有将每一项具体工作落到实处，才能有牧场牛群的良性健康发展。
