接种时间不当
雏鸡身上有母源抗体，一般在1-2周内不易感染鸡新城疫。如接种过早，反而和母源抗体中和；接种过迟，因体内抗体消失，易被毒力强的野毒侵染发病。所以，一般接种时间应在孵出后的7-10天内。
疫苗质量问题
1.部分单位生产的疫苗质量不过关，接种后不能产生相应免疫力。2.由于某些细菌、病毒存在变异株，致使疫苗本身的保护率达不到100%。3.不同的疫苗所需的运输、保存条件不同，冻干疫苗一般需要在-15℃以下冷冻保存，湿苗一般在0-4℃保存，油乳剂疫苗的保存温度一般在10℃左右。不符合条件的运输、保存，疫苗的质量得不到保障，使疫苗的免疫力大打折扣。4.接种时所用疫苗出厂时间较长，已接近失效甚至失效，必然导致免疫失败。
疫苗稀释不当
各种疫苗所需要的稀释剂、稀释倍数及稀释的方法都有一定的规定，必须严格按照使用说明进行操作。疫苗稀释用水，严格地讲应用灭菌生理盐水，否则会降低免疫效果。疫苗要现用现稀释，不可使用稀释后放置时间过长(超过4小时)的疫苗。如果饮水免疫的疫苗稀释不均，部分鸡只饮量不足等也会影响免疫效果。
免疫剂量不准
目前疫苗免疫剂量存在两种误区：一是免疫剂量不足；二是使用大剂量疫苗免疫，二者都不科学。因此，在购买疫苗时，除考虑到免疫接种过程中的损失和浪费外(损失量一般按15%—20%计算)，不要随意加大免疫用量。
稀释量不准
通常注射稀释量比较容易确定，而点眼和饮水免疫稀释量的确定则比较困难，应依据实际情况而定。
接种方法有误
不同的疫苗要求接种途径不同，免疫时一定要按规定的方法接种。饮水免疫时须加0.5%脱脂奶粉，并要求在2小时内饮完。
鸡体的状况不佳
鸡群营养不良、患病，尤其是患传染性法氏囊病以后，接种其它疫苗时往往会形成免疫抑制，使之不能产生免疫或免疫力极低，甚至引起鸡只死亡。免疫接种应安排在鸡群健康时进行，否则将影响免疫效果。
抗菌素的干扰
在用疫苗免疫的同时饮服消毒水或喂给添加抗菌药物的饲料，紧急免疫的同时使用抗菌药进行治疗等，影响了疫苗免疫力的产生。
消毒不严
接种时由于接种人员及接种用具消毒不严带入强毒病原体，从而造成免疫抑制，大大降低疫苗的免疫力。
应激因素的影响
健康的机体在良好的环境下才能获得坚强的免疫应答。饥饿、寒冷、过热、拥挤等不良因素，均能抑制机体的体液免疫和细胞免疫，降低对疫苗的免疫应答，从而导致免疫失败。
管理上的疏忽
如滴鼻、点眼时，疫苗未被吸收而又未补点，造成漏免，导致免疫失败。在疫苗稀释或接种的过程中，消毒药物过多地残留于注射器或直接接触疫苗，也能造成疫苗失效或减效。所以，在接种疫苗的前两天或后两天要避免进行带鸡消毒，这一点要引起重视。
