新疆维吾尔自治区水利厅2004年在两河两湖加强天然水域渔业资源的管理，严格实行禁渔期（区）制度，对鱼网网目规格做出明确规定，严查违规事件。新疆水产科研所成立了渔业水域环境监测中心，对全疆重要渔业水域进行定期检验，对污染事故进行预防和预报，向污染排放单位提出整改建议。
新疆渔政管理总站以乌鲁木齐市为重点，组织开展了水生野生动物特许利用专项检查，向全市100多家宾馆酒店等经营场所发放了相关法律法规和宣传材料，目的是从餐桌上挽救水生野生动物。
新疆近年来不断开发利用独特的冷水资源，发展优质冷水鱼养殖。2004年全疆冷水资源开发利用规模达75万亩。一些养鱼地区利用工厂排放的余热养殖罗非鱼、淡水白鲳等名优品种。塑料大棚保温、全封闭循环水养鱼模式得到推广。
新疆采取多种措施加快渔业发展取得良好效益，2004年渔民人均纯收入达到5446元。
