1、酚类
优点：性质稳定，在酸性中作用较强。
缺点：有特殊气味；对皮肤有刺激作用；使纺织品染色和损坏橡胶；对动物体毒性较强。
举例：如石炭酸、煤酚皂溶液(来苏儿)
2、醇类
优点：作用快，性质稳定；基本无毒，无腐蚀性；
缺点：不能杀灭细菌芽孢、真菌和病毒。
举例：如乙醇。70%乙醇相当于3%苯酚。
3、酸类
A无机酸：
作用机理；杀菌作用取决于离解的氢离子，高浓度的氢离子使菌体蛋白变性、沉淀或水解，从而杀死繁殖型微生物与芽孢。
缺点：腐蚀性较强、穿透力较差。
举例：盐酸、硫酸、硼酸、硝酸等。
B有机酸：
作用机理：杀菌作用取决于不电离的分子，它透过细菌的细胞膜而对细菌起杀灭作用。
优点：对革兰氏阳性、阴性菌均有杀灭和抑制作用，也可杀灭流感病毒。
缺点：碱性环境下效果较差，杀菌作用较弱。
C柠檬酸的缺点：
①澳大利亚兽医防疫计划不推荐用于非洲猪瘟、典型猪瘟、禽流感、新城疫、小反刍兽疫、牛瘟、口蹄疫、水疱性口炎；
②英国农业渔业食品部允许用于口蹄疫；
③有有机物时降低消毒效果：对金属有腐蚀性；对水生动物有毒。
4、碱类
作用机理：氢氧根离子使蛋白质水解、变性或沉淀。
优点：可杀灭细菌繁殖体、芽孢；对病毒有较强的杀灭作用；对寄生虫卵也有杀灭作用。
缺点：易灼伤组织，有腐蚀性，不适用于水的消毒，极易吸湿受潮，成分单一，杀毒范围窄，粗制品含量低。
举例：如氢氧化钠、生石灰。
火碱消毒的缺陷：有有机物时降低消毒效果；无表面活性作用；灼伤皮肤、眼睛、呼吸道和消化道；易吸潮，导致结块、失效；腐蚀金属，破坏环境；只能用于空舍消毒；澳大利亚兽医防疫计划规定不能用于部分烈性传染病；美国农业部不推荐用于非洲猪瘟和典型猪瘟；英国农业渔业食品部仅允许用于猪水疱病。
5、醛类
作用机理：使蛋白质变性，发挥杀菌作用。
优点：杀菌作用较醇类强，杀菌谱广泛且作用强，对细菌繁殖体、芽孢、病毒和真菌均有杀灭作用。可硬化组织。
缺点：使用受限，有刺激性、毒性，长期使用会致痛，易造成皮肤上皮细胞死亡，受污物、温度、湿度影响较大。易产生过敏，可以引起哮喘。
甲醛的缺点：消毒效果受温度影响大，低温无效；有机物和低PH值均会使其失去消毒效果：高毒和高刺激性，引起气喘病，具有潜在的致癌性；稀释比例小，用量大；澳大利亚兽医防疫计划不推荐用于非洲马瘟、口蹄疫、猪水疱病、小反刍兽疫、裂谷热、牛瘟、水疱性口炎；英国农业渔业食品部允许用于口蹄疫和猪水疱病，稀释浓度为1：9。
6、氧化剂
作用机理：通过氧化细菌体内的活性基团，破坏菌体蛋白或酶蛋白。
优点：作用快而强，广谱杀菌。对细菌、病毒、霉菌和芽孢均有效。
缺点：仅对表面有作用，易分解，不稳定。
举例：过氧乙酸。
7、卤素类
作用机理：通过卤化、氧化作用使有机物分解或丧失功能。
缺点：对金属腐蚀性大，用量大；使用条件受限，易分解。
举例：威岛、消毒王、百菌清。
碘制剂的缺点：效果短暂，消毒池消毒一天即可失效；在阳光下易分解，易产生污点；对水生动物有一定的毒性；有机物存在时效果降低；对口蹄疫病毒作用慢，2—3%需要1小时才能杀死。
8、重金属盐类
作用机理：离子与菌体蛋白结合，产生沉淀。高浓度杀菌，低浓度抑菌。
优点：防腐作用较强。
缺点：污染大，仅对细菌和真菌有效，低温、有机物能降低效果。
9、表面活性剂
作用机理：改变细胞的通透性，并使菌体蛋白变性。
分类：阴、阳、非离子和两性离子。
优点：杀菌作用强，无腐蚀、刺激性和漂白性，易溶于水，不污染物品。在碱性和中性介质中杀菌力强。
缺点：在酸性介质中效果大减，对结核杆菌、绿脓杆菌、芽孢、真菌和病毒的效果较弱。
举例：百毒杀、新洁尔灭。
10、季铵盐消毒剂的缺点
A只对细菌有效，对病毒几乎无效；
B在有机物存在条件下几乎无效；
C对水生动物毒性较大。
在生产实践中，情况比较复杂，对消毒剂的要求很高。当有机物存在(粪、尿、泥土等)，病原微生物数量大、种类多，温、湿度变化大，被消毒物品表面结构各异，水质(硬度、酸碱度)差异大时，复合消毒剂是理想选择。
试验证实单纯地使用单一的化学品消毒剂不能满足良好生物安全计划的要求；单一消毒剂都存在着一些固有的缺陷：穿透有机物能力弱，受环境温度影响大，使用浓度高，越来越严重的安全问题，价格优势的丧失等。只有复合型消毒剂才能聚众家之所长，达到综合生物安全计划的要求。
