兽疫监测系统化从上个世纪60年代起，澳大利亚就开始实施牲畜追踪体系。每头出栏的牲畜都必须携带一种有8位数字的标签，该标签贯穿于畜牧生产和流通的全过程。寄养场、饲养场和中间商都将对牲畜标签进行登记，并向国家动物标志资料中心报告。国家再通过“全国动物健康信息系统”随时收集全国动物健康资料，并通过分析，确定国家的兽疫监控能力。对于主要的动物传染病，澳大利亚有专门的监测计划。以疯牛病为例，澳大利亚就有“追踪疯牛病计划”和“疯牛病监测计划”。
高水准的兽医培训为建设一支高水准的兽医队伍，保证兽医的整体水平达到国际标准，澳大利亚实行了“兽医认证计划”。首先通过考试，选拔熟悉该国动物健康服务基本状况的人员，再对其进行培训，并让他们参加一些具体动物防疫计划的执行，最终培养出符合国际标准的兽医。此外，澳大利亚还实施了“全国兽疫应急培训计划”，向生产者、兽医、政府工作人员、救急行业人员等提供相关培训，并进行认证考试。计划的最终目的是使每个在疫情暴发时有应急反应责任的人都能够各尽其职。目前，在澳大利亚的每个州都已建立起了经过认证的骨干兽疫应急队伍。
兽疫应急准备规范化为应对动物疫情的突然暴发，澳大利亚制定了一整套应急计划，包括疫情应急培训、兽医认证、紧急疫情报告热线等。计划由动物健康澳大利亚公司负责实施。该公司出版了一系列疫情应对技术手册，并不断更新相关内容，将疫情应急管理同政府政策、战略的实施协调统一起来。另外，政府还同业界达成了 “兽疫应急反应协定”，在疫情发生时，先由政府和业界共同承担应急资金。这种在疫情发生时资金分配、培训和风险消除等方面的磋商机制，目前在世界上尚属首例。除此之外，澳大利亚还制定了全国统一的动物防疫工作标准，以衡量动物健康服务工作的质量，测评各项计划的执行情况，以保证澳大利亚的畜产品达到国际贸易对牲畜健康的要求。
