巴西农户早就知道国内运输成本高企令他们和美国和阿根廷农户相比时处于不利地位。据巴西农业及畜牧委员会发布的一份研究报告显示，巴西大豆从农场运到出口港的成本为每吨92美元，是美国和阿根廷运输成本的近四倍。
远离港口的马托格罗索州农户的成本基本更高。这份研究报告显示，马托格罗索州Sorriso地区到桑托斯港口的大豆运输成本为每吨126美元，路程超过2000公里。成本高企的原因在于卡车运输巴西近60%的大豆，相比之下，驳船或铁路运输成本更为低廉。由于路况糟糕，巴西的高速运输更高。
如果大豆通过亚马逊河或巴西东北地区出口，那么成本可能降至每吨80美元，或者节省每吨46美元。马托格罗索州农户急切等待BR-163高速公路的完工，这条公路从马托格罗索州北部修到亚马逊河。这条公路一旦完工，马托格罗索州的大豆就可以在Tapajos河装到驳船上，然后运到邻近Belem市的亚马逊河口码头。
