通知指出，2009年，两部门将在农产品重点销区和产区，支持建设和改造200家大型鲜活农产品批发市场，引导市场与基地和农户建立紧密联系，提升市场服务水平；支持400家县乡农贸市场进行标准化建设和改造，完善交易设施，改善交易环境，逐步形成以批发市场为核心，农贸市场为基础，覆盖城乡的农产品流通体系，不断降低流通成本，减少农产品损耗，拓宽流通渠道，解决农产品“卖难”问题，促进农民增收，保证城乡居民吃上“放心菜”。
通知指出，各地要根据经济发展需要，制定工作实施方案，明确项目申报、验收程序以及相关要求，按照公开、公正、公平的原则，择优选择市场，对于在抗击自然灾害、保障市场供应工作中做出突出贡献的市场予以优先考虑。
通知要求，各地要严把项目质量关，对项目实施状况进行动态监管，按照建设标准和验收规范对完成项目进行严格细致的验收。商务部财政部将对项目申请、审核、建设、验收等情况进行不定期抽查。
通知强调，各地要提高认识，加强组织领导，积极争取地方政府在规划、用地、用水、用电、税收、资金等方面出台优惠政策，落实农产品批发市场按工业用地等政策，引导金融机构加大信贷支持力度，采取措施吸引社会资金投入农产品流通基础设施建设，推动“双百市场工程”取得更大成效。
“双百市场工程”自2006年实施以来，已累计支持365家农产品批发市场和流通企业进行建设和改造，在拓宽农产品流通渠道，降低农产品流通成本，促进农民增收，保障市场供应等方面发挥了积极作用。
