2004年4月，吉林省农科院向省发改委和国家发改委提出了建设“大豆国家工程研究中心”的项目建议书；2005年3月，国家发改委批准立项，建设投资2000万元。经过两年的建设，大豆国家工程研究中心完成了规定的建设任务。
中心由两部分组成，长春院区为中心实验室所在地，主要任务是进行技术创新，进行杂交大豆和常规大豆育种技术研究；公主岭院区为试验地、种子加工厂、原原种繁育所在地，承担杂交大豆和常规大豆新品种的试验、示范、繁育、生产和经营。
吉林省农科院院长岳德荣说，大豆国家工程研究中心以实现杂交大豆的市场化和国际化为发展方向，以杂交大豆工程研究开发为主要任务。
